日本内分泌学会は2000年6月の総会において、内分泌学のさらなる発展を期するために地方組織の充実と発展が必要であるとの認識がなされ、全国に9支部が設置されました。
| 支部名 | 構成 都道府県名 | 
|---|---|
| 北海道支部 | 北海道 | 
| 東北支部 | 青森、岩手、宮城、秋田、山形、福島 | 
| 関東甲信越支部 | 茨城、栃木、群馬、埼玉、千葉、 東京、神奈川、 山梨、長野、新潟 | 
| 北陸支部 | 富山、石川、福井 | 
| 東海支部 | 静岡、岐阜、愛知、三重 | 
| 近畿支部 | 滋賀、京都、大阪、兵庫、奈良、和歌山 | 
| 中国支部 | 鳥取、島根、岡山、広島、山口 | 
| 四国支部 | 徳島、香川、愛媛、高知 | 
| 九州支部 | 福岡、佐賀、長崎、熊本、大分、宮崎、鹿児島、沖縄 | 


